大肠杆菌曾经在很长一段时间内被认为是正常肠道菌的组成部分，知道20世纪中叶，人们才认识到大肠杆菌对人体的致病性，尤其是对婴儿，常引起严重的和败血症。
造成大肠杆菌超标的原因就是包括消毒不合格、原料污染、加工过程污染等等。因此要避免大肠杆菌超标的关键就是保证整个生产过程的洁净卫生，只要一个工作人员的手不干净就可能会造成严重的污染。大肠杆菌上是很脆弱的，只要做到严格杀菌就可以全部杀死。
为避免人为污染，要从员工的穿衣戴帽和手部消毒入手。
消毒的流程是：在一更衣室换下自己的鞋子，换上拖鞋→在二更衣室换上换工作服水鞋、戴上口罩和帽子→进入风淋室→手部消毒→消毒池。
更衣室要进行消毒，可以使用臭氧或紫外线。紫外线灯管使用2-3天需要用75%浓度的酒精进行擦拭消毒，比较繁琐，因此建议在更衣室安装AORODO臭氧发生器对更衣室进行消毒。
进入车间的人员在二更衣室进行更衣的时候，需要注意穿衣顺序。先将拖鞋换成工鞋→戴口罩→穿下身衣服→穿右袖→穿左袖→系帽带→拉拉链。建议采用化纤材质的衣服，更易于清洗，而且不易沾染灰尘。
员工进入车间前的手部消毒是避免大肠杆菌超标的重要环节。
手部消毒流程：水打湿手 →→ 给皂机（放置洗手液的容器）取洗手液 →→ 手冲洗手 →→ 干手机（快速干手） →→ 手消毒器手部消毒（放置75%浓度酒精或者二氧化氯消毒液或者84消毒液）
建议春、夏、秋季节时，工作2个小时后进行手部消毒一次，手消毒时，一次性手套换掉，带上新的一次性手套后，进行手部消毒。
上海康久消毒技术有限公司研发制造的nicoler系列自动手部消毒设备是食品行业广泛使用的消毒设备，是企业是企业通过QS、GMP、HACCP等生产资质认证的必备手消毒设备。
很多食品企业，尤其是小规模企业，对手部消毒基本不重视，手部消毒方式也存在缺陷，采用含氧类消毒剂浸泡消毒或75%酒精喷洒手部，原本需持续浸泡3 分钟方达预期灭菌效果，但上班时人员集中，大多只能象征性地共用一盆消毒水浸一下，消毒时间没保障，且多人重复使用，终导致消毒水浓度不够反而造成二次污染。
实践证明，免接触的自动消毒器技术完全可以保证手部消毒的有效性和可靠性。随着《新食品安全法》的正式实施后，若在每个需要进行手部消毒的关键岗位安装一台自动消毒器技术，在达到标准要求同时，既节约大量消毒液，又提高工作效率，避免了消毒前后的二次污染，快速杀灭手部细菌，可有效解决大肠杆菌超标问题。
专业从事手消毒器技术研发和设备制造的上海康久消毒技术有限公司所研发的NCL-Q8自动消毒器技术，结束国内市场无高端自动消毒器技术的尴尬局面，灭杀手部病原微生物，阻隔细菌二次交叉感染，对营造食品安全生产环境具有划时代的意义。
做好手部消毒，再控制好车间卫生，大肠杆菌的问题，基本就解决了。